Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp1aQ2LKU9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms