Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Specc1lQ2KN98 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1lQ2KN98 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms