Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim71Q1PSW8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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