Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Traf3ip1Q149C2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Traf3ip1Q149C2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Traf3ip1Q149C2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Traf3ip1Q149C2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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