Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cpne7Q0VE82 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpne7Q0VE82 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne7Q0VE82 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms