Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam83bQ0VBM2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam83bQ0VBM2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam83bQ0VBM2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam83bQ0VBM2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms