Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r181Q0P547 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r181Q0P547 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms