Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cib3Q0P523 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib3Q0P523 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms