Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AmbpQ07456 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AmbpQ07456 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms