Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdx4Q07424 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdx4Q07424 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms