Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdf3Q07104 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gdf3Q07104 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms