Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd1Q04519 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smpd1Q04519 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smpd1Q04519 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms