Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cacna1sQ02789 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacna1sQ02789 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacna1sQ02789 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms