Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GscQ02591 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GscQ02591 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GscQ02591 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GscQ02591 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GscQ02591 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GscQ02591 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GscQ02591 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GscQ02591 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GscQ02591 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GscQ02591 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GscQ02591 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GscQ02591 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GscQ02591 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GscQ02591 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GscQ02591 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GscQ02591 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GscQ02591 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GscQ02591 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GscQ02591 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GscQ02591 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GscQ02591 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GscQ02591 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GscQ02591 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GscQ02591 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GscQ02591 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GscQ02591 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GscQ02591 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GscQ02591 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GscQ02591 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GscQ02591 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GscQ02591 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GscQ02591 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GscQ02591 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GscQ02591 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GscQ02591 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GscQ02591 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GscQ02591 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GscQ02591 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GscQ02591 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GscQ02591 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GscQ02591 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GscQ02591 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GscQ02591 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GscQ02591 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GscQ02591 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GscQ02591 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GscQ02591 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GscQ02591 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GscQ02591 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GscQ02591 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GscQ02591 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GscQ02591 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GscQ02591 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GscQ02591 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GscQ02591 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GscQ02591 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GscQ02591 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GscQ02591 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GscQ02591 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GscQ02591 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GscQ02591 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GscQ02591 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GscQ02591 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GscQ02591 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GscQ02591 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GscQ02591 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GscQ02591 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GscQ02591 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms