Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnb1Q02248 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnb1Q02248 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnb1Q02248 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms