Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcpQ01853 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VcpQ01853 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VcpQ01853 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VcpQ01853 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms