Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EgfrQ01279 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EgfrQ01279 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EgfrQ01279 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EgfrQ01279 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms