Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrcdQ00LT2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrcdQ00LT2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrcdQ00LT2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrcdQ00LT2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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