Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col8a1Q00780 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col8a1Q00780 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col8a1Q00780 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col8a1Q00780 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col8a1Q00780 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col8a1Q00780 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col8a1Q00780 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col8a1Q00780 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms