Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfaQ00731 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfaQ00731 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VegfaQ00731 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfaQ00731 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms