Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcf7Q00417 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcf7Q00417 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf7Q00417 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms