Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbp10Q000W5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms