Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IhhP97812 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IhhP97812 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IhhP97812 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IhhP97812 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IhhP97812 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IhhP97812 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IhhP97812 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IhhP97812 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IhhP97812 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IhhP97812 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IhhP97812 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IhhP97812 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IhhP97812 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IhhP97812 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IhhP97812 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IhhP97812 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IhhP97812 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IhhP97812 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IhhP97812 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IhhP97812 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IhhP97812 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IhhP97812 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IhhP97812 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IhhP97812 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IhhP97812 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IhhP97812 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IhhP97812 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IhhP97812 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IhhP97812 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IhhP97812 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IhhP97812 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IhhP97812 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IhhP97812 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IhhP97812 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IhhP97812 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IhhP97812 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IhhP97812 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IhhP97812 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IhhP97812 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IhhP97812 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IhhP97812 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IhhP97812 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IhhP97812 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IhhP97812 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IhhP97812 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IhhP97812 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IhhP97812 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IhhP97812 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IhhP97812 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IhhP97812 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IhhP97812 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IhhP97812 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IhhP97812 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IhhP97812 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IhhP97812 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IhhP97812 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms