Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr2cP97760 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr2cP97760 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr2cP97760 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms