Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptlc2P97363 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptlc2P97363 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptlc2P97363 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms