Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf1bP97358 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf1bP97358 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms