Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrp1P97333 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrp1P97333 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrp1P97333 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms