Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkdcP97313 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkdcP97313 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkdcP97313 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkdcP97313 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkdcP97313 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkdcP97313 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkdcP97313 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkdcP97313 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkdcP97313 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkdcP97313 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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PrkdcP97313 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkdcP97313 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkdcP97313 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkdcP97313 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkdcP97313 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkdcP97313 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkdcP97313 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PrkdcP97313 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PrkdcP97313 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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PrkdcP97313 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkdcP97313 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PrkdcP97313 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PrkdcP97313 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PrkdcP97313 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PrkdcP97313 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PrkdcP97313 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PrkdcP97313 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PrkdcP97313 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PrkdcP97313 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PrkdcP97313 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PrkdcP97313 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkdcP97313 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms