Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp8a1P70704 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp8a1P70704 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8a1P70704 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8a1P70704 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp8a1P70704 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms