Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad1P70340 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad1P70340 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad1P70340 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad1P70340 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad1P70340 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad1P70340 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad1P70340 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms