Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb13P70321 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb13P70321 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb13P70321 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms