Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stra8P70278 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stra8P70278 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stra8P70278 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stra8P70278 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Stra8P70278 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stra8P70278 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Stra8P70278 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stra8P70278 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Stra8P70278 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Stra8P70278 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stra8P70278 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stra8P70278 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stra8P70278 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms