Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rps17P63276 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps17P63276 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms