Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Crip1P63254 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Crip1P63254 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Crip1P63254 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip1P63254 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Crip1P63254 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms