Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd3P62320 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrpd3P62320 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd3P62320 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms