Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan5P62080 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan5P62080 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms