Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2kP61087 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2kP61087 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2kP61087 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2kP61087 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2kP61087 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2kP61087 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2kP61087 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2kP61087 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms