Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CirbpP60824 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CirbpP60824 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms