Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcbp1P60335 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcbp1P60335 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcbp1P60335 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms