Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps33bP59016 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vps33bP59016 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps33bP59016 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Vps33bP59016 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps33bP59016 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Vps33bP59016 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps33bP59016 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Vps33bP59016 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps33bP59016 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps33bP59016 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Vps33bP59016 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Vps33bP59016 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Vps33bP59016 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Vps33bP59016 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vps33bP59016 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps33bP59016 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps33bP59016 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms