Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpdl3bP58242 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpdl3bP58242 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpdl3bP58242 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms