Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snrpa1P57784 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snrpa1P57784 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snrpa1P57784 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms