Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FusP56959 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FusP56959 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FusP56959 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FusP56959 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FusP56959 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FusP56959 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FusP56959 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FusP56959 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FusP56959 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FusP56959 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FusP56959 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FusP56959 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FusP56959 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FusP56959 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FusP56959 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FusP56959 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FusP56959 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FusP56959 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FusP56959 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FusP56959 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FusP56959 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FusP56959 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FusP56959 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FusP56959 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FusP56959 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FusP56959 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FusP56959 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FusP56959 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FusP56959 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FusP56959 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FusP56959 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FusP56959 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FusP56959 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FusP56959 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FusP56959 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FusP56959 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FusP56959 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FusP56959 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FusP56959 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FusP56959 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FusP56959 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FusP56959 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FusP56959 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FusP56959 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FusP56959 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms