Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmoP56726 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmoP56726 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmoP56726 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmoP56726 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmoP56726 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmoP56726 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmoP56726 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmoP56726 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmoP56726 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SmoP56726 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmoP56726 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SmoP56726 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SmoP56726 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmoP56726 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmoP56726 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmoP56726 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmoP56726 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmoP56726 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmoP56726 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmoP56726 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmoP56726 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SmoP56726 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmoP56726 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmoP56726 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmoP56726 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmoP56726 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SmoP56726 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmoP56726 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmoP56726 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmoP56726 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmoP56726 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SmoP56726 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmoP56726 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SmoP56726 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SmoP56726 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SmoP56726 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SmoP56726 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SmoP56726 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SmoP56726 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SmoP56726 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SmoP56726 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmoP56726 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmoP56726 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SmoP56726 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SmoP56726 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmoP56726 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SmoP56726 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SmoP56726 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmoP56726 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SmoP56726 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SmoP56726 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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