Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf5P56477 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf5P56477 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Irf5P56477 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Irf5P56477 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf5P56477 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf5P56477 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irf5P56477 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms