Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RabggtbP53612 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RabggtbP53612 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RabggtbP53612 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtbP53612 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms