Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApodP51910 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApodP51910 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApodP51910 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApodP51910 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApodP51910 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApodP51910 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApodP51910 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApodP51910 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApodP51910 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApodP51910 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApodP51910 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApodP51910 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApodP51910 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApodP51910 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApodP51910 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApodP51910 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApodP51910 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApodP51910 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApodP51910 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApodP51910 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApodP51910 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApodP51910 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApodP51910 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ApodP51910 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApodP51910 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApodP51910 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApodP51910 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApodP51910 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApodP51910 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApodP51910 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApodP51910 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApodP51910 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ApodP51910 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApodP51910 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ApodP51910 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ApodP51910 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ApodP51910 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApodP51910 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApodP51910 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApodP51910 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApodP51910 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApodP51910 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApodP51910 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApodP51910 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ApodP51910 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApodP51910 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ApodP51910 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ApodP51910 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ApodP51910 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ApodP51910 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ApodP51910 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ApodP51910 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ApodP51910 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ApodP51910 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ApodP51910 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ApodP51910 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms