Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TspoP50637 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TspoP50637 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TspoP50637 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TspoP50637 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TspoP50637 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TspoP50637 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TspoP50637 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TspoP50637 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TspoP50637 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TspoP50637 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TspoP50637 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TspoP50637 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TspoP50637 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TspoP50637 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TspoP50637 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TspoP50637 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TspoP50637 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TspoP50637 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TspoP50637 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TspoP50637 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TspoP50637 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TspoP50637 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TspoP50637 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TspoP50637 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TspoP50637 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TspoP50637 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TspoP50637 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TspoP50637 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TspoP50637 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TspoP50637 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TspoP50637 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TspoP50637 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TspoP50637 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TspoP50637 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TspoP50637 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TspoP50637 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TspoP50637 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TspoP50637 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms