Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LtbrP50284 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LtbrP50284 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LtbrP50284 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LtbrP50284 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LtbrP50284 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LtbrP50284 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LtbrP50284 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LtbrP50284 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LtbrP50284 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LtbrP50284 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LtbrP50284 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LtbrP50284 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LtbrP50284 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LtbrP50284 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms