Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CtshP49935 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CtshP49935 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtshP49935 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtshP49935 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CtshP49935 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtshP49935 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtshP49935 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtshP49935 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtshP49935 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtshP49935 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CtshP49935 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtshP49935 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtshP49935 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtshP49935 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtshP49935 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtshP49935 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtshP49935 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtshP49935 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtshP49935 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtshP49935 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtshP49935 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtshP49935 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtshP49935 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtshP49935 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtshP49935 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtshP49935 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtshP49935 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtshP49935 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtshP49935 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtshP49935 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtshP49935 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtshP49935 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtshP49935 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtshP49935 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtshP49935 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtshP49935 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtshP49935 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtshP49935 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtshP49935 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtshP49935 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtshP49935 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtshP49935 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtshP49935 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtshP49935 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtshP49935 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtshP49935 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtshP49935 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtshP49935 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtshP49935 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtshP49935 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtshP49935 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CtshP49935 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtshP49935 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtshP49935 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtshP49935 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtshP49935 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CtshP49935 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtshP49935 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtshP49935 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtshP49935 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtshP49935 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtshP49935 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtshP49935 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtshP49935 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtshP49935 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtshP49935 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtshP49935 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtshP49935 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtshP49935 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtshP49935 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtshP49935 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtshP49935 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtshP49935 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtshP49935 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtshP49935 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtshP49935 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtshP49935 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtshP49935 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtshP49935 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtshP49935 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtshP49935 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtshP49935 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms